Analysis of Images in Experiments

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Documentation for package ‘ExpImage’ version 0.10.1

Help Pages

ExpImage-package ExpImage: Experimental Image Analysis Tools
as_image Transform matrix into image (Transformar matriz em imagem).
calibration_palette Function to create a color palette for image color calibration (Funcao para criar uma paleta de cores para calibracao das cores de imagens).
classify_image Filter values in an array or image (Filtrar valores em uma matriz ou imagem).
clustering_Kmeans Image segmentation by clustering using the Kmeans method (Segmentacao de imagens pela clusterização pelo metodo Kmeans).
color_pallete Creates a color palette from an image (Criar uma paleta de cores a partir de uma imagem).
compare_image Function to compare image sizes (Funcao para comparar os tamanhos das imagens).
contour_image Contorno da imagem segmentada (Outline of the segmented image.)
convert_color Convert colors (Converter cores).
create_png Create a png image with a transparent background (Criar uma imagem png com o fundo transparente)
crop_image Esta funcao corta a imagem retirando as laterais nao desejadas. (This function removes unwanted sides from the images.)
dilate_image Funcao para acrescentar bordas nos objetos.
edit_image This function changes the brightness, contrast and makes the gamma adjustment in the image (Esta funcao permite mudar o brilho, contraste e fazer um ajuste gamma na imagem).
edit_imageGUI This function changes the brightness, contrast and makes the gamma adjustment in the image (Esta funcao permite mudar o brilho, contraste e fazer um ajuste gamma na imagem).
erode_image Funcao para eliminar as bordas dos objetos.
example_image Images used as an example (Banco de imagens utilizadas como exemplo).
exclude_object Exlude objects in an image by encircling them or using a mask (Excluir objetos em uma imagem circundado-os ou usando uma mascara).
ExpImage ExpImage: Experimental Image Analysis Tools
extract_pixels Function to exclude pixels from the background or foreground in an image (Funcao para excluir em uma imagem os pixels correspondente ao background ou foreground)
getwd_script Obter o diretorio onde esta o script. (Get the script directory.)
gray_scale Function to get a grayscale image from a color image (Funcao para a obtencao de uma imagem em escala de cinza a partir de uma imagem colorida)
histogram_image Create a histogram from image bands (Criar um histrograma a partir das bandas das imagens)
index_bands Estimation of vegetation indices (Estimacao de indices de vegetacao).
info_image Image information (Informacoes sobre as imagens).
join_bands Function to compare image sizes (Funcao para comparar os tamanhos das imagens).
join_image Join images(Juntar imagens)
linearize_image Image linearization (Linearizacao da imagem).
mask_pixels Creates a mask over the background or foreground (Cria uma mascara sobre o background ou foreground)
mask_raster Creates a mask over the background or foreground in a raster image (Cria uma mascara sobre o background ou foreground em uma imagem no formato raster)
measure_image Function to obtain measurements associated with objects in binary images (Funcao para obter medidas associadas aos objetos em imagens binarias).
normalize_image Create a histogram from image bands (Criar um histrograma a partir das bandas das imagens)
Normatiza Normatiza a matriz para que os valores variem entre valores pre-estabelecidos.
pick_circle Segmentation with the shape of a circle by clicking on the image (Segmentacao com o formato de um circulo clicando em na imagem)
pick_color Selecionar os valores de RGB em pixels (Selecting RGB values in pixels).
pick_count Count objects (Contar objetos).
pick_length Measure objects in the image on click (Medir objetos na imagem ao clicar).
pick_palette Obter uma paleta de cores com cliques (Get a color palette with clicks ).
pick_resolution Get the dpi resolution on an image (Obter a resolução em dpi em uma imagem).
pick_segmentation Segmenting objects manually (Segmentação de objetos manualmente)
plot_image Esta funcao plota imagens. (This function plot the images.)
plot_indexes Function to plot multiple indices (funcao para plotar varios indices)
plot_meansures Funcao para sobrepor informacoes sobre os objetos da imagem
predict_logit Segmentacao a partir de modelo logit (Segmentation from the logit model)
predict_RF Pixel classification by Random Forest methodology (Classificacao de pixels pela metodologia Random Forest)
raster2image Convert a image in raster format to ExpImage format (Converte uma imagem no formato raster para o formato ExpImage)
read_image Function to import an image (Funcao para importa uma imagem).
resize_image Function to change image size (Funcao para mudar o tamanho da imagem)
rotate_image Esta funcao rotaciona a imagem. (This function rotates the image .)
segmentation Image segmentation function (Funcao para a segmentacao de imagens).
segmentation_logit Funcao para a segmentacao de imagens.
segmentation_logitGUI Funcao para a segmentacao de imagens.
segmentation_RF Image segmentation by Random Forest (Segmentacao de imagens por Random Forest).
segmentation_steps Image segmentation function (Funcao para a segmentacao de imagens).
setwd_script Definir o diretório do script working directory (Set the script Directory as working directory).
shape_file.BorderExtract Excluir as bordas do objetos/parcelas do shapefile
shape_file.create Funcao para criar as coordenadas dos objetos/parcelas na imagem
shape_file.plot Plotar os objetos/parcelas do shapefile na imagem
shape_file.split Divide a imagem em objetos/parcelas de acordo com o shapefile
skeletonize_image Function for skeletonization in images (Esta funcao faz a skeletonizacao em imagens).
split_image This function splits the image into several others (Esta funcao divide a imagem em varias outras de acordo com os objetos que contem)
square_image Transform the square image (Transforme a imagem quadrada).
summary_color Summarize the colors present in the segmented area of an image (Sumarizar as cores presentes na area segmentada de uma imagem).
thinning_image This function makes the thinning images(Esta funcao faz o thinning em imagens).
tif_info Image information in tif format (Informacoes das imagens no formato tif).
write_image Function to save an image (Funcao para salvar uma imagem).